Los inicios de la Casa de María se deben a la inquietud social de la Comunidad de las Hermanas de María de Schoenstatt, quienes a través de  las Hnas. M. Fridlena y M. Cristífera, en la década de los 80 visitaban a diario un campamento ubicado en la comuna La Florida. Las Hermanas de María llevaban alimentos, remedios y ropa a las personas del campamento.  También se dedicaban a escuchar y atender sus preocupaciones. Toda esta labor siempre orientada a fines pastorales y sociales.

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En el año 1985, la comuna de La Florida, decide erradicar el campamento y les entrega a las familias casas en la comuna de Puente Alto. Las Hermanas continúan acompañando a las personas del campamento en esta nueva etapa. Se van con ellos y en la nueva población les regalan hogar, atención pastoral y social. Si bien en la población tienen casa, siguen careciendo de educación y viven en la miseria. Las Hermanas adquieren la sede social de la población del Peñón, donde les regalaban alimentos, ofrecían talleres de costura, atención médica etc.

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En el año 2014 con el trabajo de la Hna. Marisol y un grupo de voluntarios la sede se reabrió para continuar atendiendo las necesidades de la población. La Casa de María se adaptó a la nueva realidad de la población, para brindar un apoyo, especialmente a los niños y sus familias.